Международный университет Кыргызстана создан Указом Президента Кыргызской Республики № УП-74 от 11 марта 1993 года и является  университетом со статусом международного высшего учебного заведения.

Учредителями университета являлись Министерство образования и науки КР, Министерство иностранных дел КР, Национальная Академия Наук КР при активной поддержке Государственного университета Сан-Франциско (США).

Указом Президента Кыргызской Республики от 30 декабря 1998 года и Постановлением Правительства Кыргызской Республики от 8 февраля 1999 года № 74 Международному университету Кыргызстана предоставлен статус автономного самоуправляемого университета, который необходим для вхождения в мировое образовательное пространство.

В дальнейшем Постановлением Правительства Кыргызской Республики № 53 от 12.02.2003 г. университет был преобразован в академический консорциум - Учебно-научно-производственный комплекс "Международный университет Кыргызстана".


В настоящее время в университете создана организационная структура, в основу которой положена евро-американская структура университетов, предполагающая автономность структурных подразделений и направленная на максимально активную деятельность в области образования и науки.

Действующая модель УНПК «Международный университет Кыргызстана» представляет собой холдинговую структуру, действуя в которой учреждения образовательного, научного, производственного профиля, усиливают потенциал друг друга и совместно работают над постоянным повышением качества.

Как международный ВУЗ, консорциум УНПК МУК ведет активную международную деятельность, внедряя инновационные методики образования и научных исследований, развивает тенденции глобализации образования, расширяет сотрудничество с университетами и организациями разных стран.